查驗中心接受衛生福利部委託特殊營養食品查驗登記審查計畫，由專業技術食品營養與科學團隊，偕同特定疾病配方食品審議小組委員，進行案件審查，建置協助業界申請特殊營養食品相關法規諮詢輔導機制，增補產業界所需的法規科學缺口，並協助業者與政府主管機關食藥署食品組協調溝通，增強業者法規知能及擔任政府與業者溝通協調之橋樑。