查驗中心接受衛生福利部委託健康食品查驗登記審查計畫，為促進國內健康食品產業升級與發展，組成食品安全、衛生、營養與科學等專業技術審查團隊，偕同健康食品審議小組委員，進行初複審兩階段審查，建置協助業界申請健康食品相關法規諮詢輔導機制，增補產業界所需的法規科學缺口，並協助業者與政府主管機關食藥署食品組協調溝通，增強業者法規知能及擔任政府與業者溝通協調之橋樑。